Kodowanie bazy danych MySQL to sposób zapisu znaków; ustawia się je podczas połączenia oraz dla tabel i pól tekstowych w bazie. Takie samo kodowanie jak baza musi mieć ustawione strona WWW z której pochodzić będą dane i na której będą wyświetlane te dane z bazy. Zalecanym kodowaniem jest UTF-8 w pełni zgodnym ze standardem Unicode, który to wspiera wszystkie języki i alfabety świata oraz polskie znaki do obsługi polskich znaków używa sie także ISO-8859-2 jest ono używane z reguły na starszych stronach ze względu na ograniczoną liczbę obsługiwanych znaków i wsparcie tylko dla kilku języków. UTF-8 jest kodowaniem wielobajtowym to jest do zapisu konkretnego znaku o danym numerze może użyć więcej niż jednego bajtu, prawie wszystkie kodowania narodowe zajmują 2 bajty za wyjątkiem systemów pisma CJK czyli wywodzących się z pisma chińskiego które to zajmują 3 bajty.